Размещается на трех этажах знаменитой «Башни Дона», имеет 28 залов, а коллекция насчитывает около 16 тысяч единиц хранения.
На первом этаже, кроме гардероба, касс и информационного отдела, находится много киосков-прилавков с разнообразными изделиями из янтаря, на любой вкус и разной цены.
Музей оснащен интерактивными экранами, где можно получить различную информацию о янтаре и экспонатах. Постоянная экспозиция музея размещена в основном на втором этаже. Вся она делится на две части.
Первая, естественно-научная часть, представляет в витринах различные по весу, цвету, степени прозрачности образцы янтаря. Здесь экспонируется самый крупный из добытых в России «солнечный камень», который весит 4280 грамма. Можно увидеть образцы с инклюзами — застывшими внутри насекомыми, веточками. Правда, фотографировать не всегда получается из-за бликов и неправильно направленного света ламп.
Во второй, культурно-исторической части, собраны украшения и предметы быта из янтаря в разные эпохи, начиная с древности.
Ведь янтарь известен с очень давних времен. Например, на Руси его называли алатырь, или латырь-камень, и приписывали ему чудодейственные свойства.
Кроме постоянной экспозиции, постоянно устраиваются временные выставки, они размещаются на третьем этаже. Кстати, на посещение выставок нужен отдельный билет. Выставки периодически обновляются, представляют зрителям настоящие произведения искусства, прекрасные авторские работы из янтаря!
Но самый удивительный экспонат выставки — скрипка из янтаря, на которой можно играть! Автор, А. М. Крылов, пишет, что он ее создал для себя, хотелось проверить свои возможности. И хотя звук этой чудо-скрипки не для консерваторского звучания, играть все-таки можно, по его просьбе выдающийся скрипач Сергей Стадлер поиграл на ней.