Этот храм считается самым старым зданием Москвы. Он был построен в 1410-1427 годах. В росписи собора участвовал Андрей Рублев, но от первоначальных фресок сохранились только фрагменты растительного орнамента на окнах.
Во время войны 1812 года храм серьезно пострадал. Французы украли многие ценности и подожгли иконостас. Из-за начавшегося пожара своды и купол храма обрушились. После войны здание восстановили с существенными изменениями.
В ХХ веке Андронников монастырь собирались снести, но старинный храм решили сохранить и реконструировать. В 1959-1960 годах зданию вернули первоначальные формы. Купол воссоздавали по примеру памятников владимиро-суздальского зодчества конца XII-начала XIII века, а закомары и кокошники — по устаревшим фрагментам.
Сегодня Спасский собор является действующим храмом и попасть внутрь может любой желающий.